SeqDepot: streamlined database of biological sequences and precomputed features
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
SeqDepot: streamlined database of biological sequences and precomputed features
UNLABELLED Assembling and/or producing integrated knowledge of sequence features continues to be an onerous and redundant task despite a large number of existing resources. We have developed SeqDepot-a novel database that focuses solely on two primary goals: (i) assimilating known primary sequences with predicted feature data and (ii) providing the most simple and straightforward means to procu...
متن کاملA Database Index to Large Biological Sequences
We present an approach to searching genetic DNA sequences using an adaptation of the sufx tree data structure deployed on the general purpose persistent Java platform, PJama. Our implementation technique is novel, in that it allows us to build su x trees on disk for arbitrarily large sequences, for instance for the longest human chromosome consisting of 263 million letters. We propose to use su...
متن کاملPrecomputed Shape Database for Real-Time Physically-Based Simulation
Adding dynamically physical properties to virtual objects can not generally be handled in real-time during a simulation. In this paper, we propose a method for handling the real-time physical simulations of arbitrary objects that are represented by their surface mesh. Our method is based on a database in which physical data are stored for a wide variety of objects. When a query object needs to ...
متن کاملthe effects of speech rate,prosodic features, and blurred speech on iranian efl learners listening comprehension
کلید واژه ها به زبان انگلیسی: effect of speech rate on listening comprehension, blurred speech,segmental and suprasegmental features,authentic speech,intelligibility, discrimination, omission, assimilation چکیده: سرعت مطالب شنیداری در کلام پیوسته بطور کلی همواره کابوسی بوده برای یادگیرنده های زبان دوم و بالاخص برای شنوندگان ایرانی. علی رغم عقل سلیم که کلام با سرعت کندتری فعالیتهای درک مطلب شن...
15 صفحه اولfeatures of short story in translated and non-translated literature: a polysystemic perspective
ترجمه متون ادبی در دنیای امروز از اهمیت ویژه ای برخوردار است. فرهنگ های مختلف با استفاده از متون ادبی ملل و فرهنگ های دیگر سعی در غنی کردن فرهنگ و ادبیات کشور خود دارند. کشور ما نیز از این قاعده مستثنی نیست. در ایران، ترجمه متون ادبی اروپائی که با دوران مشروطه ایرانی آغاز می شود موجب تغییرات اساسی در فرهنگ، شیوه زندگی و تفکر ایرانیان شده است. در این دوران نه تنها در امورات سیاسی و فکری کشور تغی...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2013
ISSN: 1367-4803,1460-2059
DOI: 10.1093/bioinformatics/btt658